阜阳现代职业学校实行校长负责制，学校党组织为党委建制，党委起政治核心保证作用。校长负责学校的发展方向，引领学校教育质量管理，具体职能部门相互配合，促进学校的科学、健康可持续发展。
       学校行政办事机构现设有办公室、教务处、教科处、政教处、总务处和安保处，纪检监察部门，另有工会和团委等群团组织。

       详细情况如下：

部  门	负责人	办公电话
办公室	李光峰	0558-2263873
教务处	张绪伦
总务处	张亚	0558-2278450
政教处	余雷
教科处	訾金城
安保处	冯新成	0558-2299110
纪检监察室	徐晓阳
工  会	张虎
团  委	陈慧慧